当寺のある旧井戸村には、国師がお生まれになったときにこの地の井戸で産湯をつかったという伝承があり、寺の南方の石段の上に「夢窓國師生誕地」の石碑があります。 　生誕地の伝承については三重県鈴鹿市の三宅町にもあります。

当山は文武天皇の時代（大宝年間）徳道上人が身の丈二丈六尺（約７.９ｍ）の十一面観世音菩薩三体を彫刻させ、その内の一体を当寺の御本尊として安置し、以来国家鎮護の勅願所となりました。

文献によると、当寺は昔（天智天皇の時代？）は大強原山盧舎那寺（おおごはらざんるしゃなじ）と呼ばれ、七堂伽藍を構えた大山であったといわれます。しかし応仁の乱の兵火にかかり焼失。その後、文亀３（１５０３）年に千種城主、千種治庸が祖父であった、千種忠顕公（後醍醐天皇の家臣）の菩提寺として境内地四町歩、田地５０石を寄進して再興。

大慧普覚禅師は圜悟克勤の法嗣で，大慧派の始祖と仰がれる大慧宗杲（そうこう）(1089-1163)のことです。秦檜（しんかい）による政争にまきこまれ，湖南の衡州（こうよう）さらには広東の梅州に流謫されという、つらい歴史を持つ禅僧です。