慶長８年(１６０３[安土桃山時代])、一世：廓全(１６２５[江戸時代]寛永二丑九月十日往生〝当山開基〟)によって開基され、地元の念仏道場として法灯が保たれてきた。

福島山長願寺は親鸞聖人を開祖とする真宗大谷派の末寺で享保二年（１７１７）の創建以来、約三百年の間、広く有縁の方々に親しまれてまいりました。現在の本堂は嘉永年中（１８４８～１８５４）に再建されたものです。

桑名別院は、正式には真宗大谷派桑名別院本統寺と称し、一般には「桑名のご坊さん」と呼ばれ親しまれております。

近年、皆が寺に集まって年忌法要をすることが多くなりました。本堂には、暖冷房の設備があり、いす席ですので、足の痛い人に好評です。

員弁寺の創建者とされている春澄朝臣善縄の子孫員弁進士行綱の子行経は祝髪し、入道となり浄源坊と称し員弁寺に住した。これが浄源寺の寺号の由来となった。