文明4年（1472年）に可児常次郎光次が、越前の国吉崎においでになった本願寺第８世蓮如上人に帰依し、法名圓西を授かり、郡上市八幡町那比の地に創建し、元和9年（1623年）本願寺13世宣如より寺号を授かりました。境内には、農民運動の父　可児義雄顕彰の碑・よしお桜や宝暦義民の那比村彦吉の墓があります。

平尾御坊願證寺は、浄土真宗開祖見眞大師親鸞聖人より第十代目本願寺第八世慧燈大師信證院蓮如上人(兼壽)の第六男信華院蓮淳法印權大僧都(兼譽)が勢州長島(現在の三重県桑名郡長島町)に永正年間(1504～1521)に開基創建されました。

慶長７年(1602)、本願寺の東西分派のおり、安八郡三塚の真徳寺（現大垣市・西派）栄寿は、不破郡平尾に真徳寺を別立して東派に属した。その後、栄寿は大垣城主石川忠総から寺地を寄進され、大垣市中町に掛所を創建した。これが大垣別院の始まりである。

美濃西国三十三観音　第十六番札所